Il Museo Diocesano Carlo Maria Martini fa parte del complesso dei Chiostri di Sant’Eustorgio. Venne inaugurato nel 2001 dal Cardinale Carlo Maria Martini a cui è poi stato intitolato nel 2017.
La collezione permanente del Museo Diocesano è costituita da ormai quasi mille opere, comprese tra il II ed il XXI secolo. La collezione è il risultato di diversi lasciti e donazioni che offre un interessante panorama della storia collezionista arcivescovile e privata.
Le collezioni sono attualmente allestite lungo i tre corpi restaurati del secondo chiostro di Sant’Eustorgio e sono in continuo arricchimento.
Fanno parte della collezione permanente anche le opere di Lucio Fontana, il Tesoro di San Nazaro e i Fondi Oro della Collezione Crespi, una delle più significative della diocesi ambrosiana.
Oggi il Museo Diocesano Carlo Maria Martini ospita mostre temporanee ed eventi culturali.