Il Museo Archeologico di Milano è collocato in un contesto architettonico straordinario, l’ex-convento del Monastero Maggiore di San Maurizio, fondato nell’VIII secolo d.C., dove la storia di Milano antica mostra ancora visibili le sue tracce. 

Il Museo Archeologico raccoglie le testimonianze di diverse culture antiche. Molte opere, di cui una selezioneè esposta nei percorsi dedicati a Milano Antica, provengono dagli scavi condotti in città a partire dall'Ottocento. Il patrimonio del museo siè poi arricchito nel corso del tempo di diverse opere, provenienti da donazioni, acquisti e depositi. Le collezioni del Museo sono esposte in diverse sale a seconda dell'ambito culturale di appartenenza. Al piano terra, superato il primo chiostro dedicato all'edilizia pubblica, si trova la sezione Milano Antica. Il percorso di visita continua al piano interrato - sezione di Arte del Gandhara e sezione Abitare a Mediolanum- e poi nel chiostro interno dove sono esposte, accanto ai resti della Milano romana (domus, mura e torri) le epigrafi degli antichi milanesi. Nella nuova ala, raggiungibile dal chiostro, al piano terra, accanto alla sala conferenze-didattica si trova la sezione dedicata a Caesarea Maritima (Israele). Al primo pianoè esposta la sezione altomedioevale, al secondo quella etrusca, mentre il terzo pianoè dedicato alla sezione greca. 

Le collezioni Egizia, di Preistoria e Protostoria sono esposte nelle Sale Viscontee del Castello Sforzesco.