Lo Stadtmuseum Jena, spesso chiamato anche Göhre, è un museo dedicato alla storia della città e del territorio. Si trova in un edificio tardo gotico di Jena, dove è ospitato anche lo spazio espositivo della Kunsthalle Jena. Inaugurato nel 1901, il percorso museale si sviluppa lungo 4 livelli e tratta la storia della città dalla preistoria al 1850 circa, con una forte attenzione sulla storia dell'università di Jena, fondata nel 1558, resa da filosofi come Reinhold, Fichte, Schelling e Hegel una Scuola di Atene tra la fine del XVIII e l'inizio del XIX secolo. Il museo si sofferma inoltre sul momento di massimo splendore di Jena, quando la città era un'importante centro dell'Impero asburgico. Sono presenti documenti, oggetti e manufatti che testimoniano lo sviluppo della città, nonché opere artistiche che mostrano vedute e paesaggi di Jena e modellini in scala. Sono inoltre presenti i reperti della battaglia del 1806, dove l'esercito prussiano si scontrò contro Napoleone.

Il museo organizza numerose mostre temporanee che approfondiscono la storia della città e le sue tradizioni popolari.