L’oratorio di San Desiderio si trova nel centro storico di Pistoia. Originariamente era la chiesa di San Desiderio fondata nel 1300 circa e comprendeva il monastero femminile benedettino. Nel 1440 il monastero venne soppresso per poi essere trasformato in un ospedale per i pellegrini in viaggio verso o di passaggio da Pistoia. Alla fine del Settecento divenne fino agli inizi del Novecento un semplice magazzino di legname.
Oggi dell’edificio originario rimangono per lo più gli affreschi di Sebastiano Vini con il Martirio dei Diecimila. L’affresco raffigura il centurione Acacio che con 9000 soldati, combattendo in nome di Cristo, riuscì a sconfiggere un esercito di 100.000 uomini. L’affresco è oggi considerato il più importante dell’artista, considerato tra i più rappresentativi nel panorama locale della seconda metà del Cinquecento.