Ospita al piano terreno e al primo piano il Museo di Arti Applicate e, al secondo piano, il Museo Bottacin.Nel Museo di arti applicate e decorative sono conservati gli oltre duemila oggetti appartenenti alle raccolte del civico Museo d'Arte Medioevale e Moderna: vetri, intagli, ceramiche, argenti, avori, gioielli, tessili, mobilio. Un numero elevato di pezzi, per la maggior parte mai esposti al pubblico, che illustra differenti tipologie di manufatti in uso a Padova tra Medioevo e seconda metà dell'Ottocento.

Suggestive ricostruzioni di ambienti, all'interno del percorso cronologico, permettono al visitatore di calarsi nello spirito e nella vita delle varie epoche, cogliendo l'evoluzione del gusto e delle diverse tecniche artistiche. Inoltre l'esposizione di più oggetti appartenenti alla medesima epoca consente di percepire facilmente i collegamenti fra quanto gli artisti e gli artigiani venivano realizzando nelle loro botteghe.

Nel Museo Bottacin trova una sistemazione funzionale l'intera collezione di Nicola Bottacin, il facoltoso commerciante che nel 1865 legò alla città il suo patrimonio d'arte e monete, riunito per lo più a Trieste intorno alla metà dell'Ottocento. In un'ideale ricostruzione dell'arredamento della sua villa triestina sono esposti i dipinti, i mobili, le sculture, le ceramiche cinesi, le armi antiche e altre opere acquisite per il decoro della sua complessa abitazione, fatta costruire nel gusto eclettico del secolo XIX.

L'esposizione si articola in due itinerari, uno dedicato alle opere d'arte, l'altro alla parte strettamente numismatica. Il percorso espositivoè fondato sulla ricostruzione più corretta possibile dell'ambiente originario e dei gusti della committenza borghese dell'Ottocento. Permette di cogliere quanto fosse diffusa l'attenzione per la pittura e la scultura di carattere accademico o tradizionale, anche se non mancano aperture ad alcuni fermenti innovativi.