Elemento di pregio delle collezioni del Museo è la collezione storica di lepidotteri ovest-paleartici, proveniente dall’ex Istituto Nazionale di Entomologia (INE) fondato dal conte Federico Hartig, La collezione, conservata negli armadi originali, risale alla prima metà del 1900 e comprende molte decine di migliaia di esemplari e decine di tipi primari.