La sezione botanica del Museo Calderini è per lo più rappresentata dalle raccolte del botanico valsesiano Antonio Carestia (1825-1908), tra i più grandi studiosi di flora valsesiana nonché botanico riconosciuto a livello internazionale. L’abate Carestia consegnò parte dell’erbario da lui creato nel maggio del 1870, continuando negli anni seguenti a incrementare la raccolta di fanerogame da lui allestita con ulteriori esemplari, aggiungendo inoltre anche raccolte di crittogame, alghe e licheni. 

La recente catalogazione e digitalizzazione delle cartelle e dei fogli d’erbario che costituiscono l’opera dell’abate valsesiano, accompagnata da una revisione critica degli esemplari, ha comportato una migliore precisazione delle originarie determinazioni e una quantificazione dei campioni musealizzati: l’erbario di proprietà dell’istituzione naturalistica risulta così composto da 1050 tra fogli e pacchetti, con 1427 specie rappresentate e per un totale di 1995 esemplari.